Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms