Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms