Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMX2Q04743 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms