Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms