Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ERCC6Q03468 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms