Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms