Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms