Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MUC3AQ02505 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC3AQ02505 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms