Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms