Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms