Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms