Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL1Q00532 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKL1Q00532 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms