Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms