Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms