Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX1P83916 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CBX1P83916 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CBX1P83916 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX1P83916 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX1P83916 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX1P83916 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX1P83916 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX1P83916 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX1P83916 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX1P83916 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX1P83916 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms