Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms