Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms