Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNB1P62873 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNB1P62873 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNB1P62873 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GNB1P62873 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms