Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms