Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms