Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTCP1P56278 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms