Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSWP56202 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSWP56202 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSWP56202 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSWP56202 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSWP56202 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSWP56202 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSWP56202 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSWP56202 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSWP56202 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSWP56202 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSWP56202 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSWP56202 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSWP56202 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSWP56202 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSWP56202 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTSWP56202 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTSWP56202 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTSWP56202 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTSWP56202 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTSWP56202 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTSWP56202 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTSWP56202 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTSWP56202 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTSWP56202 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTSWP56202 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTSWP56202 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTSWP56202 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTSWP56202 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTSWP56202 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTSWP56202 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSWP56202 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSWP56202 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSWP56202 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSWP56202 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSWP56202 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSWP56202 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSWP56202 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSWP56202 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSWP56202 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSWP56202 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSWP56202 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSWP56202 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSWP56202 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSWP56202 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSWP56202 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSWP56202 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSWP56202 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSWP56202 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSWP56202 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSWP56202 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSWP56202 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTSWP56202 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTSWP56202 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CTSWP56202 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTSWP56202 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTSWP56202 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms