Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAG2P55895 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAG2P55895 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAG2P55895 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAG2P55895 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAG2P55895 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAG2P55895 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms