Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH8P55286 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH8P55286 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH8P55286 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH8P55286 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH8P55286 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH8P55286 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH8P55286 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH8P55286 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH8P55286 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH8P55286 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH8P55286 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH8P55286 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH8P55286 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH8P55286 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH8P55286 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH8P55286 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH8P55286 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH8P55286 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH8P55286 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH8P55286 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH8P55286 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH8P55286 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH8P55286 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH8P55286 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH8P55286 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH8P55286 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms