Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFDNP55196 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFDNP55196 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AFDNP55196 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFDNP55196 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFDNP55196 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFDNP55196 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFDNP55196 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFDNP55196 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFDNP55196 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFDNP55196 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AFDNP55196 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFDNP55196 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFDNP55196 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFDNP55196 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFDNP55196 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFDNP55196 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AFDNP55196 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AFDNP55196 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFDNP55196 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFDNP55196 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFDNP55196 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFDNP55196 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFDNP55196 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFDNP55196 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFDNP55196 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFDNP55196 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFDNP55196 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFDNP55196 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFDNP55196 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFDNP55196 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFDNP55196 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFDNP55196 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFDNP55196 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFDNP55196 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms