Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms