Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GPC3P51654 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC3P51654 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC3P51654 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC3P51654 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC3P51654 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC3P51654 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC3P51654 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC3P51654 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC3P51654 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC3P51654 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC3P51654 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC3P51654 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC3P51654 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC3P51654 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC3P51654 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC3P51654 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC3P51654 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC3P51654 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC3P51654 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC3P51654 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC3P51654 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC3P51654 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC3P51654 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC3P51654 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC3P51654 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC3P51654 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC3P51654 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC3P51654 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC3P51654 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC3P51654 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC3P51654 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC3P51654 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC3P51654 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC3P51654 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC3P51654 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC3P51654 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC3P51654 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC3P51654 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms