Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms