Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DAP3P51398 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DAP3P51398 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DAP3P51398 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms