Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLAP51003 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLAP51003 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLAP51003 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLAP51003 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLAP51003 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLAP51003 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLAP51003 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLAP51003 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLAP51003 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAPOLAP51003 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAPOLAP51003 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLAP51003 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms