Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATMP50440 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATMP50440 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATMP50440 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATMP50440 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATMP50440 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATMP50440 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATMP50440 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATMP50440 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATMP50440 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATMP50440 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GATMP50440 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATMP50440 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATMP50440 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATMP50440 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATMP50440 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATMP50440 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATMP50440 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATMP50440 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATMP50440 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATMP50440 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATMP50440 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATMP50440 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATMP50440 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATMP50440 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATMP50440 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms