Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms