Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms