Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARRES1P49788 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms