Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU3F4P49335 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms