Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms