Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLMP48507 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCLMP48507 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCLMP48507 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCLMP48507 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLMP48507 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLMP48507 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLMP48507 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLMP48507 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms