Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNPDA1P46926 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNPDA1P46926 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms