Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACAA2P42765 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms