Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPOP42166 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPOP42166 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPOP42166 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPOP42166 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPOP42166 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPOP42166 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPOP42166 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPOP42166 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPOP42166 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPOP42166 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPOP42166 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPOP42166 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPOP42166 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMPOP42166 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMPOP42166 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMPOP42166 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPOP42166 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPOP42166 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMPOP42166 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMPOP42166 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMPOP42166 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMPOP42166 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMPOP42166 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMPOP42166 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMPOP42166 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMPOP42166 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMPOP42166 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMPOP42166 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMPOP42166 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPOP42166 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms