Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL1P40616 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL1P40616 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ARL1P40616 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARL1P40616 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARL1P40616 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARL1P40616 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARL1P40616 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARL1P40616 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARL1P40616 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARL1P40616 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARL1P40616 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARL1P40616 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL1P40616 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms