Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX2P40425 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX2P40425 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX2P40425 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX2P40425 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX2P40425 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX2P40425 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX2P40425 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX2P40425 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX2P40425 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX2P40425 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX2P40425 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX2P40425 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms