Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THPOP40225 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THPOP40225 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THPOP40225 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THPOP40225 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms