Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGCXP38435 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGCXP38435 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGCXP38435 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGCXP38435 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGCXP38435 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGCXP38435 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGCXP38435 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGCXP38435 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms