Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGP37231 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGP37231 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGP37231 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGP37231 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGP37231 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGP37231 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGP37231 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGP37231 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGP37231 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGP37231 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGP37231 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PPARGP37231 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPARGP37231 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPARGP37231 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms