Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms