Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4AP35499 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN4AP35499 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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