Protein–RNA interactions for Protein: P34223

SHP1, UBX domain-containing protein 1, yeast

Predictions only

Length 423 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHP1	P34223	REG1	YDR028C	3045 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	15S_rRNA	15S_rRNA	1649 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	ITC1	YGL133W	3795 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	ERG11	YHR007C	1593 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	RRM3	YHR031C	2172 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	FAR1	YJL157C	2493 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	STP2	YHR006W	1626 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	TDA2	YER071C	381 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YGR121W-A	YGR121W-A	216 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YAP5	YIR018W	738 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	STE18	YJR086W	333 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	PHD1	YKL043W	1101 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	ADI1	YMR009W	540 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	VPS20	YMR077C	666 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	INP1	YMR204C	1263 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	RPL16B	YNL069C	597 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YBR051W	YBR051W	351 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	MEI5	YPL121C	669 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YPR172W	YPR172W	603 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	KAP104	YBR017C	2757 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	ENA5	YDR038C	3276 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	SHS1	YDL225W	1656 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	BNI4	YNL233W	2679 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	GIS4	YML006C	2325 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	MSH2	YOL090W	2895 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	PRS3	YHL011C	963 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	OST6	YML019W	999 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	ADY4	YLR227C	1482 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	CWH41	YGL027C	2502 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	HFM1	YGL251C	3564 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	HOP1	YIL072W	1818 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	MSH4	YFL003C	2637 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	NEL1	YHR035W	1893 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	MNT3	YIL014W	1893 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YDL242W	YDL242W	354 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	MIX14	YDR031W	366 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YGL082W	YGL082W	1146 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YHR213W	YHR213W	597 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	SDL1	YIL167W	633 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	IST3	YIR005W	447 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	SRL3	YKR091W	741 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YAR062W	YAR062W	597 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	ATP18	YML081C-A	180 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	RPS16A	YMR143W	432 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	RPL20B	YOR312C	519 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	TFC4	YGR047C	3078 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	GYP7	YDL234C	2241 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	MYO5	YMR109W	3660 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YDR115W	YDR115W	318 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	NCB2	YDR397C	441 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	VMA8	YEL051W	771 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	SDP1	YIL113W	630 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	APQ13	YJL075C	417 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YLR076C	YLR076C	423 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	SEC14	YMR079W	915 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	RCN2	YOR220W	798 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	VPS3	YDR495C	3036 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	TSC11	YER093C	4293 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	CEP3	YMR168C	1827 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	SLN1	YIL147C	3663 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	snR84	snR84	550 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	VPS41	YDR080W	2979 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	DYN2	YDR424C	279 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	GET1	YGL020C	708 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	SLX9	YGR081C	633 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YJR141W	YJR141W	1044 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YKR033C	YKR033C	426 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	SSN8	YNL025C	972 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YBR062C	YBR062C	543 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	UTP15	YMR093W	1542 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	RCY1	YJL204C	2523 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	STN1	YDR082W	1485 nt		2.9	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	NCS2	YNL119W	1482 nt		2.9	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	MDV1	YJL112W	2145 nt		2.9	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	SPP382	YLR424W	2127 nt		2.9	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	PDS5	YMR076C	3834 nt		2.9	□□□□□ -1.94
SHP1	P34223	YDL016C	YDL016C	303 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YER066C-A	YER066C-A	501 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	LRP1	YHR081W	555 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YNL150W	YNL150W	408 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	TMA64	YDR117C	1698 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YNL193W	YNL193W	1677 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YGR228W	YGR228W	345 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	KHA1	YJL094C	2622 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	LSM8	YJR022W	330 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	ACF4	YJR083C	930 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	CWC24	YLR323C	780 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	PDR3	YBL005W	2931 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	RBL2	YOR265W	321 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	PCK1	YKR097W	1650 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	IOC3	YFR013W	2364 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YDR338C	YDR338C	2088 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YGR067C	YGR067C	2415 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	SWC4	YGR002C	1431 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	snR59	snR59	78 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YDL187C	YDL187C	330 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YDR442W	YDR442W	393 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	GIC1	YHR061C	945 nt		2.88	□□□□□ -1.95

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