Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKARP32238 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKARP32238 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKARP32238 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCKARP32238 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKARP32238 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms