Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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